2月28日,国家卫健委医政司发布2023年《国家卫生健康委办公厅关于印发2023年国家医疗质量安全改进目标的通知》,通知明确提出“感染科要提高呼吸道病原体核酸检测覆盖率和呼吸道感染性疾病核酸检测百分比”以及“医院感染控制专业应提高住院患者抗菌药物治疗前病原学送检率”等具体要求。
呼吸道传染病是全球重大公共卫生问题,早期从发热和(或)呼吸道症状患者中正确识别并明确病原学诊断是呼吸道传染病防控的关键环节。因此,对于医务人员而言,提高病原核酸检测的覆盖率和检出率至关重要,将助力临床更好地锚定致病因素,精准诊疗。
近期,异军突起的病原tNGS靶向基因检测,以其对“PCR”和“NGS”优势的兼容并蓄,在临床检验领域正受到越来越多的关注。
多重应用场景
吉因加tNGS病原靶向检测全面上线
作为业内为数不多可实现探针自研、自产的NGS检测公司,吉因加将探针杂交捕获与NGS技术相结合,推出呼吸tNGS病原靶向检测产品,能对临床感染样本进行病原鉴别、耐药检测及毒株分型。所采用的探针靶向富集技术可使整个基因组被重叠探针所覆盖,极大提高呼吸道病原体核酸检测覆盖率。日前,吉因加呼吸tNGS病原靶向检测已全面上线,包含306种病原,76类耐药,46类毒力,助力呼吸系统感染症候群病原检测。
病原鉴别:严谨的病原谱筛选规则+特异探针设计,紧贴临床需求
根据病原不同类别和致病性,并参考CHINET、CARSS等8大权威数据信息,吉因加采用严谨的病原谱筛选规则,充分考虑临床高发且关注,临床关注但传统方法难检,临床罕见、少见但传统方法难检等因素,满足临床常见菌100%覆盖的同时;纳入更多的难检菌、少见菌、罕见菌,同时实现DNA+RNA共检,紧密贴合临床需求。针对临床高发且关注、传统难检病原,进行探针特异性设计,marker区域探针高密加强,确保病原全面、精准检出。
耐药检测:76类耐药+自有解读数据库,助力临床精准用药
针对目前全球普遍关注的抗菌药物临床使用问题,尤其是耐药问题,吉因加结合耐药机制及临床关注度,以覆盖全、分型准、易解读三个原则进行耐药基因筛选,不断完善探针设计及解读数据库的建设,满足临床耐药检测需求。
覆盖全:筛选了76类耐药基因,囊括1000+耐药基因型,包含了常见细菌、结核、非结核、真菌耐药,其中结核全面覆盖了一线药、二线药及新药的耐药位点。
分型准:对耐药基因序列进行了100%探针覆盖,可实现KPC-2、3、33,NDM-1、5等的全面精准分型。
易解读:建立自有耐药解读数据库,包含1.7万余条耐药注释信息,从作用抗生素、耐药机制、疑似来源物种等维度,建立物种、临床表型关联置信度解读规则,解决耐药基因与病原菌的对应问题。
毒株分型:全基因组序列100%覆盖,实现流行毒株的精准分型
针对新冠病毒、甲/乙流、腺病毒等流行性病毒,进行全基因组序列100%探针覆盖,如对新冠病毒进行全基因组覆盖,在低病毒载量时,也可实现感染溯源、流行株分型、新变异株的发现,并且对高频变异区实现高密度探针设计,确保变异位点无漏检,实现毒株精准分型。目前,甲流可实现H1N1、H3N2、H5N1、H7N9、H9N2在内的5种分型全覆盖,腺病毒可实现13种分型的全覆盖。
tNGS检测本地化整体解决方案
助力院内真落地
作为国产NGS平台临床应用的引领者,吉因加致力于将tNGS病原检测真正落地到院端开展。为适配性能优异的tNGS呼吸病原靶向检测试剂盒,公司推出了全流程自动化的检测设备,可实现院内24 h交付,满足院端自动快捷的运行要求。
Gene+GIN I6自动化工作站自动化工作站可以实现文库构建和杂交捕获的全流程自动化,配合吉因加开发的准确快速的杂交捕获流程,可以在12 h内完成建库杂交操作,减少人工,实现无人值守的"黑灯"实验,满足临床对高时效性的要求。
Gene+Seq-100/200基因测序仪均适合病原使用场景,尤其是Gene+Seq-100基因测序仪具备快速、灵活、操作便捷的特点,是全球同等通量测序仪中速度最快的机型之—,快速便捷的特点使其更适合院端病原检测。
Gene+Box NGS全自动分析解读一体机,内置NMPA批准的病原分析软件(湘械注准20222211955),无缝直连基因测序仪,一键式操作,直接将测序数据转变为科学全面的检测报告。同时,可以实现全离线运行,保障院内数据安全。
病原tNGS靶向检测试剂盒、自动化工作站、基因测序仪和全自动化分析解读一体机的全流程优势产品组合,辅以丰富的院端落地运行经验,吉因加可为真正实现tNGS病原靶向检测院内落地运行提供一站式解决方案。
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