在生命科学领域，"空间蛋白组学"已成为解析组织微环境的核心工具。Nature Methods也将空间蛋白组学评选为 2024 年度技术。然而，基于抗体检测的技术与基于激光捕获显微切割（LCM）联合质谱的空间蛋白组技术（LCM-MS），却在技术逻辑和应用场景上存在显著差异。本文将深入剖析这两类技术的底层原理与科学价值，揭示其在精准医学中的独特定位。本文提及到的抗体检测的空间蛋白组技术主要以CODEX（PhenoCycler-Fusion，PCF）为例进行说明。

一、技术原理：靶向定位 vs. 全谱扫描

1. 抗体检测技术（CODEX）——蛋白质的“GPS导航”

循环成像：CODEX（Co-Detection by indEXing）需要将抗体与DNA条形码进行偶联，偶联抗体一次性添加到组织切片上，利用互补探针杂交和剥离方法实现循环成像。可在单张切片上实现多达100多种蛋白的同步检测。

CODEX（PCF）检测原理

核心优势：单细胞级空间分辨率（0.25μm），直接定位目标蛋白在组织中的精确坐标，尤其适合研究细胞间相互作用与空间异质

CODEX技术优势

2. LCM-MS——蛋白质的“无偏普查”

两步走策略：首先利用激光显微切割（LCM）分离特定区域（如肿瘤边界），再通过质谱（如Label-free、TMT）对数千种蛋白进行定量分析。

LCM-MS检测原理

核心优势：非靶向检测揭示全谱蛋白表达，突破抗体依赖性的限制，适用于探索未知生物标志物。

LCM-MS技术优势（摘自华盈生物）

二、应用场景：精耕细作 vs. 开疆拓土

CODEXLCM-MS

空间分辨率单细胞（250nm）区域级（10-1000 μm）

检测靶点已知功能蛋白（需抗体预设计）全蛋白组（无预设目标）

典型应用肿瘤免疫微环境、细胞通讯网络疾病分型标志物、药物靶点挖掘

数据产出高维空间映射（如细胞邻J近关系）蛋白表达定量与通路富集分析

CODEX组织原位解析头颈癌肿瘤细胞组成异质性

LCM-MS分析转移和原发卵巢癌组织中肿瘤细胞和基质细胞间的蛋白组差异性

三、技术融合：1+1>2的未来趋势

两类技术并非对立，而是形成互补闭环。CODEX技术进行空间结构解析 → LCM-MS分析感兴趣结构区域的蛋白表达谱。

CODEX指导的LCM-MS分析

结语

"空间"在生物学中不仅是位置坐标，更是功能调控的密码。抗体成像技术以"显微镜"般的精准绘制蛋白质地图，质谱技术则以"卫星遥感"的广度解码蛋白组全景。二者协同将推动从描述性研究向机制性洞察的跨越，最终实现"空间多组学"在精准医疗中的终极愿景。

丨公司简介

上海华盈生物医药科技有限公司(简称：华盈生物)，以“科学家服务科学家”的初心专注于高通量蛋白质研究服务领域12年。目前已经形成了以 “蛋白质谱”、“蛋白芯片”“空间蛋白组”为核心的“三位一体”高通量蛋白质检测服务体系。2023年，华盈生物与美国Akoya公司合作，引进PCF空间单细胞蛋白组平台，成为Akoya中国大陆首家认证技术服务商，进入全球CRO服务网络，华盈生物的技术能级也正式提升进入空间组学时代。

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